Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms