Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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