Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms