Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVDP53602 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVDP53602 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVDP53602 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms