Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERFP50548 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms