Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms