Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPOP42166 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPOP42166 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms