Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms