Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHCGRP22888 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms