Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DPA1P20036 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms