Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms