Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA2P17301 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms