Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms