Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms