Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms