Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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