Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms