Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNUPNO95149 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms