Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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