Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA2O43364 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA2O43364 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms