Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TO15178 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TO15178 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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