Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BHLHE40O14503 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms