Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRPO00591 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRPO00591 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms