Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms