Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms