Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBC2A0A5B9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms