Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms