Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms