Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALD1Q9ULE6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms