Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms