Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNA1Q9UIW2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNA1Q9UIW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms