Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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