Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms