Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms