Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms