Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VNN3Q9NY84 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms