Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms