Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms