Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms