Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms