Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC4A5Q9BY07 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms