Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC106Q9BWC9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms