Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms