Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms