Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms