Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SH3GL3Q99963 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SH3GL3Q99963 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SH3GL3Q99963 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SH3GL3Q99963 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SH3GL3Q99963 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms