Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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