Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms