Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF31Q96EP0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF31Q96EP0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms