Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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